Okulumuz Eyüp Aygar Fen Lisesinin inşaatına, Milli Eğitim Bakanlığı ile Aygar Narenciye adına Eyüp Aygar arasında imzalanan 21/04/2011 tarihli protokol uyarınca başlanmıştır. İnşaat süresi üç (3) yıl olarak planlanmasına karşın, hayırsever tarafından 1,5 yıl gibi kısa bir sürede tamamlanarak 17.09.2012 tarihinde eğitim-öğretime açılmıştır.
Okul, İlimiz Yenişehir İlçesi Menteş Mahallesi, 20K11 Pafta, 6091 Ada ve 1 parsel üzerinde bulunmaktadır. 13.490 m2 alan üzerine kurulmuştur. Yapılan protokole göre okulumuz 30 derslikli ve pansiyon 300 öğrenci kapasiteli olarak planlanmıştır. Pansiyon kız/erkek olarak düşünülmüştür. Halen hem kız hem de erkek öğrenciler kalmaktadır.
İnşa edilen okulun adı Eyüp Aygar Fen Lisesi öğrenci pansiyonun adı ise Fatma Aygar Öğrenci Yurdudur. Okulumuz halen Yenişehir İlçesi, Limonluk Mahallesi, 36. Cadde No:2 de faaliyettedir.
"Çalışmak Önceliğimiz, başarmak geleneğimizdir."
Çalışmak önceliğimiz , Başarmak geleneğimiz sloganı ile çıktığımız yolda ,İdarecilerimizin , Öğretmenlerimizin gayretleri ile Öğrencilerimizin çalışmaları , başta velilerimiz olmak üzre İlçe Milli Eğitim Müdürümüz ve İl Milli Eğitim Müdürümüzün destekleri ile bu yılda önemli bir başarıya imza attık,öğrencilerimizin hepsini yürekten kutluyor tercih´lerinde de aynı başarıyı yakalamalarını diliyoruz,emeği geçen herkese canı gönülden teşekkür ediyoruz.
Okulumuz açıldığı günden bugüne kadar tüm paydaşları ile üstün başarılara imza atmıştır. ÖSYM'nin yaptığı sınavlar ile ülkemizin önde gelen üniversitelerine binlerce öğrenci yerleştirmiştir. En başarılı liseler sıralamasında okulumuz Türkiye genelinde her zaman ilk 10'da yer almıştır. Ayrıca hazırladığımız ulusal ve uluslararası birçok proje kabul edilmiş ve başarılı bir şekilde gerçekleştirilmiştir. Okulumuz Mersin'de TEOG'ta en yüksek puanla öğrenci alan okuldur.